Comparative nanopore sequencing-based evaluation of the midgut microbiota of the summer chafer (Amphimallon solstitiale L.) associated with possible resistance to entomopathogenic nematodes
Artykuł naukowy w czasopiśmie recenzowanyCzasopismo: International Journal of Environmental Research and Public Health (ISSN: 1660-4601)
Współautorzy: Sajnaga Ewa, Skowronek Marcin, Kalwasinska Agnieszka, Kazimierczak Waldemar, Lis Magdalena, Jach Monika Elżbieta, Wiater Adrian
Rok wydania: 2022
Tom: 19(6)
Numer czasopisma: e3480
Strony od-do: 1-16
Streszczenie: Występujące w glebie i odżywiające się korzeniami roślin larwy niektórych gatunków żukowatych (m. in. guniaka czerwczyka Amphimallon solstitiale) są poważnymi szkodnikami upraw w Europie. Do ich zwalczania stosuje się nicienie entomopatogeniczne (EPN). Rezultaty naszych badań dostarczają pierwszej szczegółowej charakterystyki społeczności bakteryjnej jelita środkowego u dzikich larw A. solstitiale na podstawie sekwencjonowania nanoporowego genu 16S rRNA. W całym zbiorze danych wykryliśmy 2586 różnych rodzajów i 11641 gatunków, z tylko 83 różnymi rodzajami bakterii wspólnymi dla wszystkich badanych osobników, które mogą reprezentować członków podstawowej mikroflory jelita środkowego larw A. solstitiale. Następnie porównaliśmy mikroflorę jelita środkowego osobników opornych na EPN i grupy kontrolnej (nie poddanej ekspozycji na EPN), przyjmując hipotezę, że odporność na infekcję przez EPN może być powiązana ze składem mikrobiomu jelita. W porównaniu z grupą kontrolną, mikrobiom owadów odpornych na infekcję przez EPN wykazywał niższe wskaźniki Shannona i Evennessa oraz istotne różnice w strukturze zbiorowisk. Nasze badania potwierdziły, że odporność owadów może być związana ze składem mikroflory jelitowej. Istnieje jednak wiele procesów, które mogą wpływać na zgrupowania bakterii jelitowych. Niezbędne są wobec tego dalsze badania nad rolą mikroflory jelitowej w oddziaływaniach między owadami a nicieniami pasożytniczymi. Mogą one pomóc udoskonalić strategię biologicznej kontroli liczebności populacji szkodników owadzich.
Słowa kluczowe: mikrobiom jelita, nicienie entomopatogeniczne, oporność na patogeny, interakcje patogen-gospodarz, Scarabaeidae, sekwencjonowanie nanoporowe, metataksonomika, biokontrola
Dostęp WWW: https://www.mdpi.com/1660-4601/19/6/3480
DOI: 10.3390/ijerph19063480
Cytowanie w formacie Bibtex:
@article{1,
author = "Waldemar Kazimierczak and Sajnaga Ewa and Skowronek Marcin and Kalwasinska Agnieszka and Kazimierczak Waldemar and Lis Magdalena and Jach Monika Elżbieta and Wiater Adrian",
title = "Comparative nanopore sequencing-based evaluation of the midgut microbiota of the summer chafer (Amphimallon solstitiale L.) associated with possible resistance to entomopathogenic nematodes",
journal = "International Journal of Environmental Research and Public Health",
year = "2022",
number = "e3480",
pages = "1-16"
}
Cytowanie w formacie APA:
Kazimierczak, W. and Sajnaga Ewa and Skowronek Marcin and Kalwasinska Agnieszka and Kazimierczak Waldemar and Lis Magdalena and Jach Monika Elżbieta and Wiater Adrian(2022). Comparative nanopore sequencing-based evaluation of the midgut microbiota of the summer chafer (Amphimallon solstitiale L.) associated with possible resistance to entomopathogenic nematodes. International Journal of Environmental Research and Public Health, e3480, 1-16.